את המושג כתף הינום טבע הארכיאולוג גבי ברקאי, שחפר את מערכת הקבורה כאן. המושג מורכב משני חלקים: “כתף היבוסי” ו”גיא בן הינום”. באתר נמצאו שבע מערות קבורה חצובות בסלע מימי מלכי יהודה, כלומר מתקופת בית ראשון. במערות אלו נקברו דורות על גבי דורות של משפחות ירושלמיות חשובות.